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腦干腫瘤的預(yù)后與許多因素有關(guān)。腫瘤的部位、病理性質(zhì)、治療選擇等因素與預(yù)后有一定關(guān)系。中腦區(qū)腫瘤相對好于腦橋腫瘤;Ⅰ～Ⅱ級星形細(xì)胞瘤預(yù)后優(yōu)于多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤。CT掃描表現(xiàn)為Ⅰ型者預(yù)后較好，Ⅲ型預(yù)后差。腫瘤大小亦與預(yù)后有關(guān)，腫瘤越大，預(yù)后越差。根據(jù)腦干腫瘤的手術(shù)經(jīng)驗表明：

1.脊髓延髓腫瘤、延髓腦橋下部膠質(zhì)細(xì)胞瘤的成人患者 手術(shù)效果差，術(shù)后病死率高，術(shù)前及術(shù)后的神經(jīng)功能障礙(如呼吸、吞咽困難等)，迫使長期要為患者維持人工呼吸。雖然如此，也不能有效地挽救患者的生命。

2.腦干上段腫瘤的患者 術(shù)后效果較好，且長期生存率高，可能由于中腦腫瘤多為良性型之故。

3.惡性腫瘤 術(shù)后效果較良性腫瘤明顯的差，而膠質(zhì)細(xì)胞瘤(Ⅳ級)患者術(shù)后生存期一般不超過6個月。

4.膨脹(局灶)型腫瘤 術(shù)后效果（zui）好。

5.成人患者的手術(shù)危險性比兒童大。

6.隨訪(6個月～9年)的資料顯示，腦干上段腫瘤的復(fù)發(fā)率為6%，而腦干下段腫瘤的復(fù)發(fā)率為21%。